在处理员工不能胜任工作的问题时，公司应首先明确降薪是否合法。根据《中华人民共和国劳动法》及相关法规，降薪属于变更劳动合同内容的行为，必须经过双方协商一致或符合法定情形。在员工不能胜任工作的情况下，公司不能单方面决定降薪，而应当与员工进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。

此外，即使员工不能胜任工作，公司也不能直接以降薪作为惩罚手段。因为降薪涉及到员工的切身利益，必须确保降薪决定的合法性和合理性。公司应当提供充分的证据证明员工不能胜任工作，并说明降薪的具体原因和依据。同时，降薪幅度也应当合理，不能过分损害员工的合法权益。

如果公司未经员工同意或未遵循法定程序擅自降薪，员工有权向劳动仲裁机构或法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

员工不能胜任工作时，公司不能直接采取降薪措施。降薪属于变更劳动合同内容的行为，必须经过双方协商一致或符合法定情形。在处理这类问题时，公司应当与员工进行充分的沟通和协商，寻找合适的解决方案。如果员工确实无法胜任工作，公司可以考虑提供培训、调整岗位或解除劳动合同等合法手段。同时，公司也应当遵守相关法律法规，确保降薪决定的合法性和合理性，避免侵犯员工的合法权益。